L'Etat est impliqué dans le cadre du Contrat de projets 2007-2013. Son objectif, précisé dans la DTA (Directive Territoriale d’Aménagement) de l’aire métropolitaine lyonnaise, est de développer l'offre ferroviaire pour les voyageurs.

La Région Rhône-Alpes est le « chef d’orchestre » du projet. Elle est le principal financeur des investissements portant sur le matériel roulant et la modernisation des infrastructures.

Le Département du Rhône, en tant qu’autorité organisatrice des transports routiers non urbains de personnes, participe au projet dont l’impact attendu sur les routes départementales est important.

Le Grand Lyon (Communauté Urbaine de Lyon) est maître d’ouvrage aux « abords » des gares.

Réseau Ferré de France est le gestionnaire et le propriétaire des infrastructures. Sa mission est de moderniser son réseau en cohérence avec les enjeux sociaux, économiques et environnementaux de son territoire.

La SNCF assure la conception et la réalisation de l’atelier de maintenance du tram-train à l’Arbresle. Elle met en œuvre l’offre commerciale sur la base des orientations prises par la Région.